پیدا کردن موتیف در نواحی بالادست ژن های هم بیان بر اساس الگوریتم بهینه سازی فاخته و سرمایش تدریجی
نویسندگان
چکیده مقاله:
چکیده: در این مقاله برای حل مسئله کشف موتیف یک روش ترکیبی جدید بر اساس الگوریتم بهینهسازی فاخته، روش سرمایش تدریجی و بیشینهسازی زمان انتظار بهنام SA-COAMF ارائه میشود. این روش ترکیبی در همگرایی بهینه سراسری بسیار کارآمد است. یکی دیگر از ویـژگـیهـای شـاخـص ایـن الـگوریتـم، بهـره بـردن از هـر دو مـدل نمـایـش مـوتیـف (تـوالـی اجمـاع و مـاتـریـس احتمـالاتی) اسـت. عملکرد الگوریتم پیشنهادی بر روی یـک مجموعه از دادههـای زیستی (پـایگـاه داده SCPD) تسـت شـده و بـا تعـدادی از الگوریتمهـای معـروف کشف مـوتیـف (GA-DPAF، PSO+ و MEME) مقایسه میگردد. نتایج بهدستآمده نشاندهنده توانایی بالای الگوریتم پیشنهادی است.
منابع مشابه
کاربرد الگوریتم بهینه سازی فاخته در بهره برداری بهینه از مخزن برقآبی (مطالعه موردی: مخزن کارون4)
تاکنون الگوریتمها و روشهای بهینهسازی مختلفی در بهرهبرداری بهینه از مخازن با اهداف مختلف بکار گرفته شدهاند. به تازگی، از الگوریتم بهینهسازی فاخته(COA) ، به عنوان یک الگوریتم تکاملی (EA) جدید، در حل تعدادی از توابع معیار و مسائل واقعی بهرهوری گردیده، و عملکرد و توانایی بالای آن در حل مسائل بهینهسازی دشوار گزارش شده است. هدف این مقاله بررسی کارایی COA در سامانهی منابع آب، به منظور استخراج...
متن کاملطراحی بهینه نیروگاههای تولید پراکنده در شبکه توزیع با استفاده از الگوریتم بهینه سازی فاخته و مقایسه با روشهای پیشین
چکیده: با توجه به روند روبه رشد استفاده از منابع تولید پراکنده، طراحی بهینه این واحدها در سیستم قدرت بخصوص در شبکه توزیع لازم و ضروری است. در این مقاله جهت تعیین مکان و اندازه بهینهی منابع تولید پراکنده از الگوریتم بهینه سازی فاخته با اهداف چندگانه، استفاده شده است. اهداف بررسی شده عبار اند از: کاهش تلفات خطوط، کاهش انحراف متوسط ولتاژ و پایداری ولتاژ. الگوریتم فاخته یک الگوریتم مبتنی بر جمعیت ...
متن کاملیافتن کوتاهترین مسیر شبکه با استفاده از الگوریتم بهینه سازی فاخته در سیستم اطلاعات مکانی
امروزه مسیریابی در شبکههای شهری با افزایش حجم اتومبیلها و نیز محدودیتهای ترافیکی گوناگون امری ضروری محسوب میشود. روشی که در این پژوهش به منظور حل مسأله کوتاهترین مسیر برای نخستین بار پیشنهاد شده است، استفاده از الگوریتم بهینهسازی فاخته میباشد. علت انتخاب این الگوریتم، جدید بودن و نیز پاسخ مناسبی است که این الگوریتم برای حل مسأله مسیریابی، نسبت به سایر الگوریتم‍های فراابتکاری داده است. در ...
متن کاملالگوریتم بهینه سازی کوانتوم فاخته
امروزه، استفاده از الگوریتم های ابتکاری برای حل مسائل مهندسی، پیشرفت چشم گیری داشته است. در سال های اخیر، تلفیق مباحث کوانتومی (که الهام گرفته از فیزیک کوانتوم می باشد) با الگوریتم های ابتکاری مطرح شده است. علت استفاده از مباحث کوانتومی، افزایش تنوع جمعیت در الگوریتم ها و گریز از بهینه محلی مسائل بهینه سازی می باشد. این تلفیق، سبب پیدایش الگوریتم های پیشنهادی متعددی شده است. از جمله این الگوریت...
ارزیابی و مقایسه الگوریتم های بهینه سازی ژنتیک، شبیه سازی تبرید و فاخته ها در مکان یابی رقابتی تسهیلات (مطالعه موردی: بانکها)
این مقاله به مکانیابی بانکها تحت شرایط رقابتی با سطوح جذابیت متفاوت پرداخته است. مساله مکانیابی بانکها به فاکتورهای زیادی نیاز داشته و جزء مسایل NP-HARD طبقهبندی میشود. استفاده از روشهای فراابتکاری برای حل مسایل NP-HARD علیرغم تقریبی بودن، مناسبترین راه حل به نظر میرسد. در این تحقیق از روشهای بهینهسازی ژنتیک، شبیهسازی تبرید و الگوریتم بهینهسازی فاختهها در حل مساله مکانیابی رقابتی ب...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 46 شماره 3
صفحات 333- 344
تاریخ انتشار 2016-09-22
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023